Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TrioQ0KL02 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrioQ0KL02 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrioQ0KL02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TrioQ0KL02 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrioQ0KL02 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms