Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcnt1Q09324 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcnt1Q09324 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcnt1Q09324 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcnt1Q09324 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcnt1Q09324 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gcnt1Q09324 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcnt1Q09324 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gcnt1Q09324 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcnt1Q09324 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gcnt1Q09324 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gcnt1Q09324 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcnt1Q09324 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcnt1Q09324 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcnt1Q09324 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcnt1Q09324 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcnt1Q09324 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gcnt1Q09324 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcnt1Q09324 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms