Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSM2AQ08AH3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSM2AQ08AH3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSM2AQ08AH3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSM2AQ08AH3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms