Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBL2Q08999 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RBL2Q08999 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBL2Q08999 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBL2Q08999 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBL2Q08999 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms