Protein–RNA interactions for Protein: Q08890

Ids, Iduronate 2-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IdsQ08890 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IdsQ08890 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IdsQ08890 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IdsQ08890 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IdsQ08890 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IdsQ08890 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IdsQ08890 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IdsQ08890 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IdsQ08890 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IdsQ08890 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IdsQ08890 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IdsQ08890 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IdsQ08890 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IdsQ08890 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IdsQ08890 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IdsQ08890 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IdsQ08890 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IdsQ08890 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms