Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDR1Q08345 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDR1Q08345 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DDR1Q08345 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDR1Q08345 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDR1Q08345 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDR1Q08345 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms