Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Col17a1Q07563 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Col17a1Q07563 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Col17a1Q07563 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Col17a1Q07563 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Col17a1Q07563 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Col17a1Q07563 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Col17a1Q07563 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Col17a1Q07563 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Col17a1Q07563 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Col17a1Q07563 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Col17a1Q07563 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Col17a1Q07563 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Col17a1Q07563 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms