Protein–RNA interactions for Protein: Q06194

F8, Coagulation factor VIII, mousemouse

Predictions only

Length 2,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8Q06194 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8Q06194 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8Q06194 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8Q06194 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F8Q06194 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8Q06194 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F8Q06194 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8Q06194 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8Q06194 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8Q06194 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8Q06194 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8Q06194 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8Q06194 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
F8Q06194 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8Q06194 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8Q06194 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8Q06194 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8Q06194 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
F8Q06194 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8Q06194 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8Q06194 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8Q06194 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
F8Q06194 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8Q06194 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8Q06194 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8Q06194 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8Q06194 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8Q06194 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8Q06194 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8Q06194 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8Q06194 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8Q06194 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8Q06194 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8Q06194 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8Q06194 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8Q06194 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8Q06194 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
F8Q06194 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
F8Q06194 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8Q06194 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8Q06194 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8Q06194 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8Q06194 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
F8Q06194 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8Q06194 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8Q06194 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
F8Q06194 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
F8Q06194 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8Q06194 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8Q06194 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8Q06194 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8Q06194 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8Q06194 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8Q06194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8Q06194 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8Q06194 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8Q06194 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
F8Q06194 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
F8Q06194 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8Q06194 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8Q06194 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8Q06194 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8Q06194 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8Q06194 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8Q06194 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8Q06194 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8Q06194 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8Q06194 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8Q06194 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8Q06194 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8Q06194 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8Q06194 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8Q06194 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8Q06194 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8Q06194 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8Q06194 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8Q06194 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
F8Q06194 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
F8Q06194 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8Q06194 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8Q06194 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8Q06194 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8Q06194 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8Q06194 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8Q06194 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8Q06194 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F8Q06194 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
F8Q06194 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8Q06194 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8Q06194 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
F8Q06194 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8Q06194 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8Q06194 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8Q06194 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8Q06194 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8Q06194 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8Q06194 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8Q06194 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8Q06194 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8Q06194 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms