Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC63Q05C16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC63Q05C16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC63Q05C16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC63Q05C16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms