Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMX1Q04741 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMX1Q04741 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMX1Q04741 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX1Q04741 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms