Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL10A1Q03692 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL10A1Q03692 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL10A1Q03692 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL10A1Q03692 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL10A1Q03692 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL10A1Q03692 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL10A1Q03692 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL10A1Q03692 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL10A1Q03692 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms