Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFHR1Q03591 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFHR1Q03591 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFHR1Q03591 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFHR1Q03591 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms