Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPARDQ03181 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARDQ03181 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPARDQ03181 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms