Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddr1Q03146 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddr1Q03146 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddr1Q03146 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddr1Q03146 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddr1Q03146 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddr1Q03146 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms