Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nucb1Q02819 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nucb1Q02819 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nucb1Q02819 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nucb1Q02819 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nucb1Q02819 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nucb1Q02819 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nucb1Q02819 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nucb1Q02819 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms