Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLOD1Q02809 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD1Q02809 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLOD1Q02809 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLOD1Q02809 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms