Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APBA1Q02410 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APBA1Q02410 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA1Q02410 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA1Q02410 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA1Q02410 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
APBA1Q02410 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2
APBA1Q02410 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APBA1Q02410 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
APBA1Q02410 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA1Q02410 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA1Q02410 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA1Q02410 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA1Q02410 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA1Q02410 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA1Q02410 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA1Q02410 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
APBA1Q02410 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA1Q02410 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APBA1Q02410 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APBA1Q02410 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBA1Q02410 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms