Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP27A1Q02318 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP27A1Q02318 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP27A1Q02318 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYP27A1Q02318 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms