Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnnb1Q02248 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnb1Q02248 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnnb1Q02248 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnnb1Q02248 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnnb1Q02248 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnnb1Q02248 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms