Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gbp1Q01514 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gbp1Q01514 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Gbp1Q01514 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp1Q01514 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp1Q01514 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms