Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F8a1Q00558 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
F8a1Q00558 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F8a1Q00558 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F8a1Q00558 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F8a1Q00558 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms