Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK16Q00536 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK16Q00536 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK16Q00536 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms