Protein–RNA interactions for Protein: P99025

Gchfr, GTP cyclohydrolase 1 feedback regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GchfrP99025 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GchfrP99025 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GchfrP99025 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GchfrP99025 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GchfrP99025 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GchfrP99025 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GchfrP99025 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GchfrP99025 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GchfrP99025 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GchfrP99025 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GchfrP99025 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms