Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2C1P98194 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2C1P98194 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2C1P98194 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2C1P98194 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2C1P98194 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2C1P98194 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2C1P98194 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2C1P98194 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP2C1P98194 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2C1P98194 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2C1P98194 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP2C1P98194 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2C1P98194 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2C1P98194 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2C1P98194 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2C1P98194 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2C1P98194 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2C1P98194 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms