Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Scn1bP97952 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1bP97952 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1bP97952 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1bP97952 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1bP97952 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1bP97952 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1bP97952 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1bP97952 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1bP97952 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1bP97952 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1bP97952 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1bP97952 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1bP97952 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1bP97952 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1bP97952 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1bP97952 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1bP97952 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1bP97952 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn1bP97952 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scn1bP97952 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn1bP97952 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn1bP97952 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scn1bP97952 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scn1bP97952 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn1bP97952 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn1bP97952 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms