Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfdP97946 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfdP97946 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfdP97946 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfdP97946 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfdP97946 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfdP97946 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfdP97946 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfdP97946 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfdP97946 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfdP97946 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfdP97946 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VegfdP97946 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfdP97946 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfdP97946 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfdP97946 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfdP97946 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VegfdP97946 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VegfdP97946 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VegfdP97946 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfdP97946 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfdP97946 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfdP97946 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfdP97946 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfdP97946 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfdP97946 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfdP97946 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VegfdP97946 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VegfdP97946 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms