Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cry1P97784 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cry1P97784 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cry1P97784 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cry1P97784 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cry1P97784 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cry1P97784 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry1P97784 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry1P97784 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cry1P97784 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cry1P97784 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry1P97784 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cry1P97784 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms