Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarcc1P97496 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarcc1P97496 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Smarcc1P97496 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarcc1P97496 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarcc1P97496 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarcc1P97496 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarcc1P97496 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarcc1P97496 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarcc1P97496 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarcc1P97496 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarcc1P97496 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarcc1P97496 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarcc1P97496 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarcc1P97496 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms