Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NyxP83503 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NyxP83503 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NyxP83503 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NyxP83503 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NyxP83503 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NyxP83503 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NyxP83503 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NyxP83503 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NyxP83503 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NyxP83503 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NyxP83503 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NyxP83503 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NyxP83503 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NyxP83503 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NyxP83503 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NyxP83503 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NyxP83503 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NyxP83503 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NyxP83503 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NyxP83503 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NyxP83503 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NyxP83503 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NyxP83503 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NyxP83503 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NyxP83503 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NyxP83503 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NyxP83503 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NyxP83503 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NyxP83503 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NyxP83503 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NyxP83503 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NyxP83503 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NyxP83503 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NyxP83503 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NyxP83503 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NyxP83503 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NyxP83503 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NyxP83503 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NyxP83503 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NyxP83503 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NyxP83503 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NyxP83503 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NyxP83503 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NyxP83503 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NyxP83503 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NyxP83503 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NyxP83503 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NyxP83503 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NyxP83503 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NyxP83503 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NyxP83503 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NyxP83503 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NyxP83503 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NyxP83503 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NyxP83503 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NyxP83503 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NyxP83503 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NyxP83503 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NyxP83503 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NyxP83503 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NyxP83503 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NyxP83503 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NyxP83503 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NyxP83503 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NyxP83503 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NyxP83503 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NyxP83503 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NyxP83503 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NyxP83503 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NyxP83503 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NyxP83503 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NyxP83503 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NyxP83503 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NyxP83503 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NyxP83503 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NyxP83503 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NyxP83503 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NyxP83503 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NyxP83503 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NyxP83503 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NyxP83503 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NyxP83503 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NyxP83503 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NyxP83503 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NyxP83503 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NyxP83503 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NyxP83503 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NyxP83503 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NyxP83503 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NyxP83503 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NyxP83503 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NyxP83503 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NyxP83503 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NyxP83503 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NyxP83503 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NyxP83503 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NyxP83503 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NyxP83503 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NyxP83503 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms