Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRPS9P82933 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MRPS9P82933 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MRPS9P82933 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS9P82933 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MRPS9P82933 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms