Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIM1P81133 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIM1P81133 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIM1P81133 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIM1P81133 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIM1P81133 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIM1P81133 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIM1P81133 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIM1P81133 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIM1P81133 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIM1P81133 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIM1P81133 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIM1P81133 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIM1P81133 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIM1P81133 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIM1P81133 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIM1P81133 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIM1P81133 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIM1P81133 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIM1P81133 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIM1P81133 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIM1P81133 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIM1P81133 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIM1P81133 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIM1P81133 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIM1P81133 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIM1P81133 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIM1P81133 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIM1P81133 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIM1P81133 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIM1P81133 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIM1P81133 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIM1P81133 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIM1P81133 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIM1P81133 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIM1P81133 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIM1P81133 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIM1P81133 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIM1P81133 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIM1P81133 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIM1P81133 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIM1P81133 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIM1P81133 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIM1P81133 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIM1P81133 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIM1P81133 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIM1P81133 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIM1P81133 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIM1P81133 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIM1P81133 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIM1P81133 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIM1P81133 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIM1P81133 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIM1P81133 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIM1P81133 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIM1P81133 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIM1P81133 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIM1P81133 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIM1P81133 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIM1P81133 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIM1P81133 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIM1P81133 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIM1P81133 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIM1P81133 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIM1P81133 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIM1P81133 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIM1P81133 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIM1P81133 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIM1P81133 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIM1P81133 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIM1P81133 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIM1P81133 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIM1P81133 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIM1P81133 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIM1P81133 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIM1P81133 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIM1P81133 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIM1P81133 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIM1P81133 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIM1P81133 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIM1P81133 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIM1P81133 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIM1P81133 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIM1P81133 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIM1P81133 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIM1P81133 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIM1P81133 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIM1P81133 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIM1P81133 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIM1P81133 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIM1P81133 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIM1P81133 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIM1P81133 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIM1P81133 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms