Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx2P81066 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx2P81066 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx2P81066 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx2P81066 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx2P81066 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx2P81066 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irx2P81066 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx2P81066 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx2P81066 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx2P81066 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms