Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otx2P80206 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otx2P80206 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otx2P80206 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otx2P80206 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otx2P80206 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otx2P80206 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Otx2P80206 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otx2P80206 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Otx2P80206 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otx2P80206 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otx2P80206 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Otx2P80206 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otx2P80206 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otx2P80206 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otx2P80206 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otx2P80206 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otx2P80206 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms