Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX6-1P78426 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-1P78426 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms