Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ASIC1P78348 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ASIC1P78348 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ASIC1P78348 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms