Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC5P78333 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC5P78333 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GPC5P78333 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GPC5P78333 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPC5P78333 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC5P78333 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC5P78333 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC5P78333 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC5P78333 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC5P78333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC5P78333 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC5P78333 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC5P78333 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC5P78333 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC5P78333 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC5P78333 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC5P78333 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC5P78333 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC5P78333 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC5P78333 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC5P78333 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC5P78333 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC5P78333 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GPC5P78333 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC5P78333 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC5P78333 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC5P78333 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC5P78333 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC5P78333 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC5P78333 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC5P78333 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC5P78333 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC5P78333 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC5P78333 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC5P78333 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC5P78333 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC5P78333 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC5P78333 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC5P78333 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC5P78333 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC5P78333 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC5P78333 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC5P78333 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC5P78333 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC5P78333 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC5P78333 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC5P78333 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPC5P78333 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPC5P78333 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GPC5P78333 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GPC5P78333 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPC5P78333 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GPC5P78333 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPC5P78333 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC5P78333 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC5P78333 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GPC5P78333 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC5P78333 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC5P78333 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPC5P78333 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPC5P78333 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC5P78333 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPC5P78333 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC5P78333 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPC5P78333 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GPC5P78333 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC5P78333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC5P78333 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC5P78333 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC5P78333 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC5P78333 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC5P78333 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC5P78333 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC5P78333 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC5P78333 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC5P78333 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC5P78333 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC5P78333 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC5P78333 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC5P78333 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC5P78333 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC5P78333 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC5P78333 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC5P78333 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC5P78333 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC5P78333 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC5P78333 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC5P78333 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC5P78333 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC5P78333 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC5P78333 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC5P78333 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC5P78333 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC5P78333 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC5P78333 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC5P78333 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC5P78333 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC5P78333 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms