Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sparcl1P70663 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sparcl1P70663 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sparcl1P70663 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sparcl1P70663 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sparcl1P70663 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sparcl1P70663 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms