Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shox2P70390 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shox2P70390 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shox2P70390 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shox2P70390 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Shox2P70390 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shox2P70390 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shox2P70390 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shox2P70390 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shox2P70390 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Shox2P70390 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shox2P70390 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shox2P70390 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shox2P70390 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shox2P70390 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms