Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp4P70343 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Casp4P70343 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp4P70343 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp4P70343 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp4P70343 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp4P70343 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp4P70343 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp4P70343 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp4P70343 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp4P70343 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp4P70343 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp4P70343 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp4P70343 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp4P70343 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms