Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec4fP70194 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec4fP70194 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec4fP70194 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clec4fP70194 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec4fP70194 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec4fP70194 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms