Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBBP68871 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBBP68871 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBBP68871 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBBP68871 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HBBP68871 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBBP68871 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBBP68871 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBBP68871 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBBP68871 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBBP68871 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBBP68871 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBBP68871 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBBP68871 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBBP68871 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBBP68871 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBBP68871 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBBP68871 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBBP68871 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBBP68871 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBBP68871 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBBP68871 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBBP68871 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBBP68871 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBBP68871 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBBP68871 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBBP68871 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBBP68871 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HBBP68871 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HBBP68871 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HBBP68871 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HBBP68871 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HBBP68871 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HBBP68871 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HBBP68871 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HBBP68871 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HBBP68871 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HBBP68871 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HBBP68871 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HBBP68871 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HBBP68871 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HBBP68871 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HBBP68871 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HBBP68871 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HBBP68871 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HBBP68871 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HBBP68871 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HBBP68871 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HBBP68871 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HBBP68871 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HBBP68871 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HBBP68871 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HBBP68871 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HBBP68871 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HBBP68871 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HBBP68871 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HBBP68871 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HBBP68871 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HBBP68871 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HBBP68871 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HBBP68871 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HBBP68871 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HBBP68871 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HBBP68871 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HBBP68871 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HBBP68871 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HBBP68871 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HBBP68871 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HBBP68871 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HBBP68871 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HBBP68871 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HBBP68871 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HBBP68871 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HBBP68871 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HBBP68871 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HBBP68871 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HBBP68871 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HBBP68871 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HBBP68871 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HBBP68871 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HBBP68871 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HBBP68871 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HBBP68871 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBBP68871 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBBP68871 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBBP68871 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBBP68871 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBBP68871 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBBP68871 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBBP68871 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBBP68871 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBBP68871 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBBP68871 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBBP68871 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBBP68871 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBBP68871 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBBP68871 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBBP68871 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBBP68871 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBBP68871 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms