Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn5P68500 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn5P68500 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntn5P68500 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn5P68500 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn5P68500 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms