Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkcbP68404 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkcbP68404 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkcbP68404 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcbP68404 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkcbP68404 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkcbP68404 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PrkcbP68404 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkcbP68404 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcbP68404 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkcbP68404 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms