Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTA1P68133 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTA1P68133 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTA1P68133 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTA1P68133 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms