Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpnP63163 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpnP63163 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpnP63163 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SnrpnP63163 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpnP63163 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpnP63163 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms