Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tra2bP62996 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tra2bP62996 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tra2bP62996 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tra2bP62996 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tra2bP62996 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tra2bP62996 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tra2bP62996 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tra2bP62996 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tra2bP62996 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms