Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRA2BP62995 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRA2BP62995 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRA2BP62995 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRA2BP62995 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms