Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBX1P62877 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBX1P62877 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBX1P62877 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBX1P62877 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBX1P62877 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBX1P62877 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBX1P62877 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBX1P62877 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBX1P62877 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBX1P62877 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBX1P62877 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBX1P62877 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBX1P62877 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBX1P62877 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBX1P62877 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBX1P62877 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBX1P62877 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RBX1P62877 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBX1P62877 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBX1P62877 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBX1P62877 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBX1P62877 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBX1P62877 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBX1P62877 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBX1P62877 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBX1P62877 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBX1P62877 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBX1P62877 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBX1P62877 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBX1P62877 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBX1P62877 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBX1P62877 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBX1P62877 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBX1P62877 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBX1P62877 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBX1P62877 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBX1P62877 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBX1P62877 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBX1P62877 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBX1P62877 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBX1P62877 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBX1P62877 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RBX1P62877 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBX1P62877 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBX1P62877 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBX1P62877 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBX1P62877 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBX1P62877 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBX1P62877 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBX1P62877 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBX1P62877 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBX1P62877 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBX1P62877 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBX1P62877 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBX1P62877 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBX1P62877 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBX1P62877 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBX1P62877 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBX1P62877 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBX1P62877 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBX1P62877 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBX1P62877 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBX1P62877 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBX1P62877 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBX1P62877 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBX1P62877 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBX1P62877 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBX1P62877 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBX1P62877 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBX1P62877 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBX1P62877 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBX1P62877 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBX1P62877 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBX1P62877 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBX1P62877 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBX1P62877 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBX1P62877 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms