Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF6P62330 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF6P62330 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF6P62330 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF6P62330 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF6P62330 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF6P62330 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF6P62330 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF6P62330 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF6P62330 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF6P62330 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF6P62330 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF6P62330 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF6P62330 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF6P62330 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF6P62330 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF6P62330 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF6P62330 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF6P62330 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF6P62330 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARF6P62330 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARF6P62330 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARF6P62330 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARF6P62330 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARF6P62330 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARF6P62330 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARF6P62330 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARF6P62330 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARF6P62330 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARF6P62330 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARF6P62330 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARF6P62330 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARF6P62330 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARF6P62330 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARF6P62330 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARF6P62330 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARF6P62330 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARF6P62330 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARF6P62330 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARF6P62330 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARF6P62330 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARF6P62330 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARF6P62330 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARF6P62330 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARF6P62330 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARF6P62330 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARF6P62330 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARF6P62330 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARF6P62330 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARF6P62330 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARF6P62330 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARF6P62330 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARF6P62330 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARF6P62330 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARF6P62330 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARF6P62330 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARF6P62330 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARF6P62330 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARF6P62330 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARF6P62330 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARF6P62330 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARF6P62330 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARF6P62330 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARF6P62330 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARF6P62330 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARF6P62330 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARF6P62330 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARF6P62330 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARF6P62330 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARF6P62330 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARF6P62330 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARF6P62330 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARF6P62330 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARF6P62330 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARF6P62330 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARF6P62330 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ARF6P62330 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARF6P62330 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARF6P62330 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARF6P62330 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARF6P62330 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARF6P62330 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARF6P62330 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARF6P62330 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARF6P62330 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARF6P62330 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms