Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsm3P62311 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsm3P62311 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lsm3P62311 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsm3P62311 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm3P62311 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm3P62311 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm3P62311 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm3P62311 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm3P62311 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm3P62311 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm3P62311 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm3P62311 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm3P62311 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm3P62311 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm3P62311 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm3P62311 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm3P62311 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm3P62311 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm3P62311 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lsm3P62311 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lsm3P62311 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lsm3P62311 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm3P62311 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms